대만원숭이는 약 10,000마리, 그 수가 약 250,000마리에 달합니다. 과도한 사냥, 특히 벌목으로 인해 대만원숭이의 수가 감소하고 있으며, 이는 서식지에 막대한 피해를 입혔습니다. 1984년 대만 당국은 보호 전략을 제안하고 대만원숭이를 보호하기 위해 "얼수이", "타이둥", "켄팅"과 같은 자연보호구역을 순차적으로 설립하여 이 독특한 종을 효과적으로 보호했습니다. 또한 소수의 대만원숭이가 일본의 일부 섬에 도입되었습니다.